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Otimizar o processamento do main_BR #24

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claudia-codeco opened this issue Nov 29, 2023 · 0 comments
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Otimizar o processamento do main_BR #24

claudia-codeco opened this issue Nov 29, 2023 · 0 comments
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@claudia-codeco
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objetivo geral

Identificar oportunidades para melhorar a performance do main_BR.R tornando-o paralelizável

O objetivo do main_BR é rodar o pipeline do AlertTools e gerar a tabela historico_alerta que é usada no Infodengue (site e boletins).

Os inputs para o main_BR são:

  • data do relatorio
  • unidades da federação
  • doencas

Os processamentos são:

  • lê as cidades de cada estado, no banco de dados (poderia ser otimizado, se tivesse uma tabela local)

  • para cada cidade e doença:

  • AlertTools::pipe_infodengue lê dados de casos do banco de dados, clima e calcula indicatores para municipios e retorna uma lista.

  • AlertTools::tabela_historico lê a lista acima e gera um data.frame com indicadores a mais (tbm precisa de acesso ao banco de dados).

  • salva localmente os objetos

  • num outro loop, faz-se a escrita. Tem varias funcoes de escrita, precisamos ver quais efetivamente estão sendo usadas.

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