diff --git a/tools.md b/tools.md
index 1a53d8ace..9f238a549 100644
--- a/tools.md
+++ b/tools.md
@@ -2,19 +2,24 @@
layout: default
---
-# European Galaxy tools (2801 and counting)
+# European Galaxy tools (3634 and counting)
Get Data
+
+
-
-
-
-
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+
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-
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-
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@@ -26,6 +31,13 @@ layout: default
+
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+
+
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@@ -38,8 +50,10 @@ layout: default
+
+
@@ -63,15 +77,19 @@ layout: default
Send Data
-
-
-
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+
Collection Operations
-
-
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@@ -87,58 +105,58 @@ layout: default
+
Expression Tools
-
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General Text Tools
Text Manipulation
-
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-
-
+
@@ -149,6 +167,7 @@ layout: default
+
@@ -163,14 +182,29 @@ layout: default
+Convert Formats
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
Filter and Sort
-
+
+
-
-
+
+
@@ -180,8 +214,8 @@ layout: default
Join, Subtract and Group
-
+
@@ -191,44 +225,67 @@ layout: default
Genomic File Manipulation
Convert Formats
-
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-
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@@ -241,27 +298,43 @@ layout: default
-
FASTA/FASTQ
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@@ -270,8 +343,6 @@ layout: default
-
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@@ -290,29 +361,35 @@ layout: default
+
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@@ -329,173 +406,170 @@ layout: default
-
-
+
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+
Quality Control
-
+
SAM/BAM
-
-
-
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BED
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VCF/BCF
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Nanopore
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@@ -509,11 +583,13 @@ layout: default
+
Common Genomics Tools
Operate on Genomic Intervals
+
-
+
@@ -526,6 +602,7 @@ layout: default
+
@@ -541,100 +618,97 @@ layout: default
Genomics Analysis
Annotation
-
-
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@@ -658,109 +732,172 @@ layout: default
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Multiple Alignments
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-
-
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Assembly
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@@ -768,113 +905,138 @@ layout: default
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Mapping
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Variant Calling
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@@ -897,122 +1059,173 @@ layout: default
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Genome editing
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-RNA-Seq
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-RNA Analysis
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+RNA-Seq
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+RNA Analysis
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@@ -1028,7 +1241,6 @@ layout: default
-
@@ -1036,51 +1248,71 @@ layout: default
+
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@@ -1105,7 +1337,6 @@ layout: default
-
@@ -1116,37 +1347,46 @@ layout: default
-
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Peak Calling
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+
Epigenetics
-
-
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@@ -1162,6 +1402,11 @@ layout: default
+
+
+
+
+
@@ -1173,42 +1418,45 @@ layout: default
+
Phylogenetics
-
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@@ -1218,6 +1466,16 @@ layout: default
+
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+
+
Phenotype Association
@@ -1225,8 +1483,6 @@ layout: default
-
-
@@ -1237,72 +1493,101 @@ layout: default
Single-cell
-
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+Spatial Omics
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Genomics Toolkits
Picard
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+
@@ -1311,161 +1596,156 @@ layout: default
deepTools
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Gemini
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EMBOSS
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NCBI Blast
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@@ -1480,49 +1760,50 @@ layout: default
-
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HiCExplorer
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+
@@ -1538,23 +1819,28 @@ layout: default
+
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+
+
+
RAD-seq
+
+
+
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+
+
-
-
-
-
-
-
-
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@@ -1601,104 +1887,89 @@ layout: default
Metagenomics
Metagenomic Analysis
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+
@@ -1709,16 +1980,112 @@ layout: default
-
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+
Qiime
@@ -1890,6 +2257,7 @@ layout: default
DNA Metabarcoding
+
@@ -1897,245 +2265,264 @@ layout: default
-
-
+
+Data and Metadata Management
+
+
+
+
+
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+
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+
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+
+
Virology
-
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+
Proteomics, Metabolomics, Chemistry
Proteomics
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+
@@ -2150,12 +2537,15 @@ layout: default
+
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+
@@ -2174,40 +2564,97 @@ layout: default
+
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Metabolomics
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@@ -2219,25 +2666,25 @@ layout: default
-
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@@ -2249,43 +2696,65 @@ layout: default
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ChemicalToolBox
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@@ -2293,11 +2762,8 @@ layout: default
-
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Statistics and Visualisation
Statistics
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Machine Learning
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Graph/Display Data
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@@ -2505,36 +3006,56 @@ layout: default
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+Muon Spectroscopy
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Miscellaneous Tools
Evolution
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Motif Tools
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Test Tools
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@@ -2543,19 +3064,6 @@ layout: default
-
-
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-
-
@@ -2566,13 +3074,15 @@ layout: default
-
+
GIS Data Handling
-
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+
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-
@@ -2581,12 +3091,25 @@ layout: default
+
+
+
+
+
Animal Detection on Acoustic Recordings
+Compute indicators for satellite remote sensing
+
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+
Regional Variation
@@ -2636,124 +3159,147 @@ layout: default
Climate Analysis
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Apollo
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Imaging
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+
Species abundance
@@ -2774,16 +3320,57 @@ layout: default
+Compute indicators for turnover boulders fields
+
+
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+Ecoregionalization
+
+
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+
+Indicators from geometric mean
+
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+Astronomy
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Interactive tools
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-
+
@@ -2800,6 +3387,15 @@ layout: default
+
+
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+
+
+
+
+
+
OBO Ontology manipulation
@@ -2819,7 +3415,6 @@ layout: default
HCA-Single Cell
-
@@ -2834,52 +3429,303 @@ layout: default
+
-SAM/BAM Manipulation
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-Metagenomic Analysis
-
-
-
-
-
-
-GATK Tools
-
Other Tools
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+
+
Biodiversity data exploration
-
-
+
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+
+
+
Sanger Sequencing
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+
+
+Extract Features
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+QIIME 2
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+
+
+Metagenomic Analysis
+
+
+
+
+
+
+GATK Tools
+
+Data Managers
+
+XAS (X-ray Absorption Spectroscopy)
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+
+
+Built-in Converters
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