Ce projet nécessite d’avoir assimilé l’ensemble des notions du sixième module du cours de science des données biologiques 2. Il correspond au dépôt GitHub https://github.com/BioDataScience-Course/B06Ia_fish_market. Il est distribué sous licence CC BY-NC-SA 4.0.
Les données employées proviennent du site Kaggle : https://www.kaggle.com/datasets/vipullrathod/fish-market/data. Il s'agit de mesures morphométriques sur sept espèces de poissons prélevés sur un marché.
Ce projet est individuel et cadré. Il vous permet de compléter vos compétences en statistiques multivariées en développant les aptitudes suivantes :
- Pouvoir calculer des matrices de distances avec un indice de distance judicieusement choisi
- Être capable de réaliser des dendrogrammes (CAH) avec la méthode de liens la plus adéquate et les interpréter
- Pouvoir réaliser et interpréter une analyse par les k-moyennes
- Comparer les méthodes des k-moyennes et CAH afin de choisir celle qui convient le mieux à chaque analyse
Réalisez une exploration multivariée de données mesurées sur des poissons issus d'un marché matinal.
Complétez le fichier fish_notebook.qmd.
N'oubliez pas de réaliser un "Rendu" de vos documents en HTML à la fin pour vérifier que tout fonctionne bien (attention : si le document ne compile pas sans erreurs, vous n'aurez pas de points pour ce projet) et utilisez les tests à disposition dans l'onglet "Construire" -> bouton "Construire tout". Corrigez les erreurs éventuelles rencontrées à ce stade avant de clôturer votre travail. Vérifiez également que votre dernier commit a bien été pushé sur GitHub avant la deadline.