Le but du devoir est de combiner les informations des modèles anatomiques (GRANAR et MECHA) et architecturaux (MARSHAL).
En particulier, vous devez :
- générer une anatomie avec GRANAR (Shiny app)
- utiliser cette anatomie pour estimer des parameters hydrauliques locaux avec MECHA (via Binder)
- utiliser ces valeurs de conductivité dans un système racinaire complet à l'aide de MARSHAL
Encore plus précisément, vous devez répondre aux questions suivantes
- quel est l'effet de l'anatomie sur Kr
- quel est l'effet de l'anatomie des racinaires primaires sur Krs
- quel est l'effet de l'anatomie des racinaires laterales sur Krs
Vous pouvez choisir UN SEUL paramètre anatomique au choix à changer (+ ou - 50%).
Vous devez choisir une des deux architectures fournies dans le dossier /MARSHAL/outputs
Les anatomies de base des racines principales et laterales se trouvent dans le dossier /GRANAR/GRANAR/model_params
Le repertoire contient un RMD permettant de faire tourner Marshal et un permettant de faire tourner GRANAR.
Vous devez nous fournir un graphique qui permette de répondre à chacune des questions