linux

Fixes tested live #1723

Job	Run time
pip (3.11, .)	49s
pip (3.11, .[actions])	49s
pip (3.11, .[docs])	49s
pip (3.12, .)	48s
pip (3.12, .[actions])	52s
pip (3.12, .[docs])	53s
pip (3.13, .)	58s
pip (3.13, .[actions])	55s
pip (3.13, .[docs])	1m 16s
CI	5m 45s
lint	46s
docs	52s
createEnvs (CONDA_SHARED_ENV)	2m 37s
createEnvs (CONDA_CREATE_INDEX_ENV)	1m 48s
createEnvs (CONDA_RNASEQ_ENV)	2m 14s
createEnvs (CONDA_RMATS_ENV)	1m 55s
createEnvs (CONDA_scRNASEQ_ENV)	2m 38s
createEnvs (CONDA_seurat3_ENV)	1m 21s
createEnvs (CONDA_loompy_ENV)	1m 33s
createEnvs (CONDA_alevinqc_ENV)	1m 57s
createEnvs (CONDA_eisaR_ENV)	2m 16s
createEnvs (CONDA_DNA_MAPPING_ENV)	2m 2s
createEnvs (CONDA_CHIPSEQ_ENV)	2m 14s
createEnvs (CONDA_ATAC_ENV)	2m 4s
createEnvs (CONDA_HIC_ENV)	2m 22s
createEnvs (CONDA_WGBS_ENV)	2m 29s
createEnvs (CONDA_DSS_ENV)	2m 5s
createEnvs (CONDA_RMD_ENV)	1m 48s
createEnvs (CONDA_PREPROCESSING_ENV)	1m 48s
createEnvs (CONDA_NONCODING_RNASEQ_ENV)	2m 9s
createEnvs (CONDA_SAMBAMBA_ENV)	1m 33s
createEnvs (CONDA_pysam_ENV)	1m 37s
createEnvs (CONDA_FQLINT_ENV)	1m 25s
	57m 27s

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